市售益生菌種類繁多，許多家長為讓孩子更健康，花大錢購買，但小兒科醫師表示，很多市售產品都誇大療效，事實上絕對不是「吃愈多愈貴愈好」，家長不必有迷思。 台南新樓醫院小兒肝膽腸胃科醫師鄭超宏表示，益生菌發展一個世紀以來，對於療效已有一些釐清，根據美國耶魯大學在去年最新的研究，真的可以達到療效的益生菌只有數種而已，且還要吃夠劑量才有效果。
鄭超宏表示，益生菌大致分為3大類，乳酸桿菌類通稱A菌、比菲德氏菌類稱B菌及其他，每一類都有許多不同品種的益生菌，根據耶魯的研究，有療效的只有其中2、30種，且療效還分A、B、C級，A 級才算真的能拿來治療用。 例如研究中顯示抗生素引起的腹瀉，使用LGG益生菌可達到A級療效，或因牛奶產生的過敏造成異位性皮膚炎，使用LGG菌也有效。
但目前市售益生菌很多打的廣告好像萬靈丹，包括整腸健胃、促進消化、抗過敏及提升免疫力，都是誇大，門診中常有家長詢問，「醫師，到底該買哪一種、一定要吃嗎」。 有些產品標榜複合多種菌，每盒動輒4、5千元，孩子只能吃1個月，一般家庭很難負擔，但家長不買又覺得對不起孩子，鄭超宏表示，事實上根據研究如同時混吃不同種類的益生菌，可能因彼此間競爭，效果打折扣。
某一種益生菌可治療某一種腹瀉，不代表所有的益生菌都有整腸健胃效果，根據過去的研究，通常是只有少數幾種菌能治療某一種特定的腹瀉。 到底該吃多少？研究還不夠多，但基本上最少每次要吃上億個才有效，很多只是在食品、牛奶中添加少數，就強調有療效，也是誇大。建議家長不必隨便亂買給孩子吃，應詢問醫師，再針對症狀購買。
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